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DNA研究解决方案
RNA分析解决方案
Illumina Genome Analyzer II高通量基因组分析系统
传统分子生物学实验服务系列
生物信息学服务系列

DNA研究解决方案

Illumina光纤微珠芯片平台的SNP分型研究
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在疾病监测、新药研究以及个体化医疗中具有重大的产业价值。
Illumina激光共聚焦微珠芯片平台(BeadArrayTM)是一种能进行大规模药物筛选、遗传变异及功能分析的高效工具。该技术是HapMap计划(国际人类基因组单体型图计划)的主要平台,HapMap一期数据的70%都出自Illumina平台。HapMap计划作为人类基因组计划的后续计划,中国科学家完成了其中的10%的工作,而这些工作有95%是在Illumina平台完成的。除了对HapMap的贡献外,在SNP研究领域,Illumina平台被大量用于肿瘤,心血管疾病,精神疾病,各种免疫性疾病等复杂疾病的研究,进行药物遗传学研究及病禽畜的育种研究。
特点:高基因组覆盖率(Illumina革命性的Infinium HD技术使得任意位点的SNP检测成为可能,从而提高了探针密度及覆盖率);
强大的统计学分析(标签SNP位点的选择可使研究者用尽可能少的样本发现SNP与疾病的相关性);
更加准确的数据(全基因组关联分析时的高匹配率及高重复行);
更加敏感的CNV检测(CNV检测时的低干扰信号);
强大的细胞遗传学数据;
多种芯片形式(可同时检测2,4或12个样本)。

全基因组SNP分型研究
Human1M-duo
Human660w-quad
Human510s-duo
HumancytoSNP-12

※GoldenGate自定义SNP分型检测芯片
goldengate custom panels

※iSelect自定义SNP芯片
iselect custom panels
完全根据研究需要挑选SNP位点进行研究。每张芯片可平行做12个样品,每个样品可检测7,600 - 60,800个SNP位点。

针对性SNP分型研究
牛全基因组分型芯片(BovineSNP50 Genotyping BeadChip
犬全基因组分型芯片(CanineSNP20 Genotyping BeadChip
马全基因组SNP分型芯片(EquineSNP50 Genotyping BeadChip
猪全基因组SNP分型芯片(PorcineSNP60 Genotyping BeadChip
羊全基因组SNP分型芯片(OvineSNP50 Genotyping BeadChip
肿瘤相关SNP芯片
主要组织相容性研究芯片

连锁分析
人类连锁分析芯片

Illumina光纤微珠芯片平台的DNA甲基化研究
DNA甲基化在调节基因表达中扮演一个重要的角色,在正常的细胞发育和维持组织稳定性方面被认为有着重要的作用机制。许多研究表明——人类的许多疾病的病因(包括癌症)都是由于异常的甲基化引起的。检测基因组的甲基化有助于甲基化研究的快速发展,最终发展成为诊断人类疾病,预防和治疗方面的有效工具。


HumanLinkage-12
小鼠低密度和中密度连锁分析芯片
小鼠低密度连锁分析芯片
小鼠中密度连锁分析芯片

人类全基因组甲基化芯片HumanMethylation27
GoldenGate 甲基化肿瘤芯片
※GoldenGate自定义甲基化芯片

Illumina光纤微珠芯片平台的拷贝数变化和杂合性缺失研究
拷贝数变化和杂合性缺失(LOH)是肿瘤细胞中一种非常常见的DNA变异。长期的细胞遗传学的研究证实,几乎所有的肿瘤细胞都存在染色体片段的非随机性丢失。而基因拷贝数的变化,往往与神经功能、细胞生长的调节、新陈代谢以及某些疾病有关。这些变化的研究越来越成为疾病研究的热点。
Illumina DNA研究芯片形成的数据可以用来分析人类基因组中已报道的或者新产生的拷贝数变异位置。对于一些已报道的,即有可能存在变异的CNV区域,Illumina DNA研究芯片上高密度的标签可以做到精确估计。

拷贝数变化和杂合性缺失芯片
自定义CNV研究解决方案

Beckman GenomeLab SNPstream基因分型系统
联合基因引进的Beckman GenomeLab SNPstream基因分型系统是一套自动化的多重SNP分析系统,在特制384孔板的每个微孔中可分析12个或48个SNP位点。该系统已广泛应用于遗传图谱标记的绘制、疾病诊断和疾病易感基因的鉴别、药物代谢和药物遗传学、法医鉴定和个体识别等遗传相关研究和应用领域。
准确——采用贝克曼独家专利的单碱基引物延伸SNP(SNP-it)检测技术,准确率高达99%,通过集成的综合软件使质控和数据统计一体化,全程100%质量控制;
快速——灵活的多路线技术与先进的自动化操作保证每天可以处理4,600-3,000,000个基因型,大大加快了您的科研进度;
高转化率——科研工作者常常发现,约有50%的基因或者序列并不适合基于荧光定量PCR的方法,而我们转化率高达85%,完全可以弥补这一缺陷;
超低样本量——每个基因型检测仅需0.04ng的DNA。许多研究者存有多年的、背景资料详实的石蜡包埋块样本,我们也只需薄薄两片,这就是我们无可比拟的天然优势。
可同时进行:10到数百个 SNPs位点检测
48到数千个 DNA 样本
检测物种:人类、老鼠、牛、植物、果蝇、细菌等
检材:血液、组织、细胞培养、口腔黏膜拭子等

TaqMan SNP基因分型方法
——基于ABI Prism? 7900型荧光定量PCR仪的SNP分型系统
7900HT型荧光定量PCR仪包括对于已知的单一核苷酸多态性(SNP)作大规模筛选的软件。在一对等位基因系统中,用对应于两个等位基因的两个MGB探针在同一个试管中做多重PCR反应。反应终止时所产生的荧光用7900HT型荧光定量PCR仪进行测定,实验结果通过分析软件迅速取得。

SNPlex™System SNP分型方法
——基于ABI3130xl基因分析仪的超高通量SNP基因分型技术方法
基于Applied Biosystems3130基因分析仪的超高通量SNP基因分型技术方法,采用通用的多重OLA/PCR 技术和不同长度的ZipChute?杂交探针,根据杂交探针的电泳迁移率不同从而检测位点分型情况。

STR分析(短串联重复序列分析)
——基于ABI3130xl基因分析仪的STR分析
服务范围:亲子鉴定、个体识别、动物包括克隆动物的鉴定、家系连锁分析等。
按照您的要求,为您设计实验方案,包括荧光标记的选择,引物的设计、合成和标记,荧光分子量 Marker 的选用,仪器的选择等等;?
按照所设计的实验方案完成荧光 PCR,并在ABI3130测序仪上完成电泳扫描,数据采集;
用 GeneScan3.0 和 GenoTyper2.0 等软件对收集到的数据进行处理分析,将产物片段大小、数量多少的信息转化成直观准确的波形图谱,为您下一步进行关联分析或连锁分析等遗传分析提供数据可靠的数据。

 

 

RNA分析解决方案

Illumina光纤微珠芯片平台的基因表达谱研究
Illumina全基因组表达谱微珠芯片系列
全基因组表达谱微珠芯片使得在更高通量水平上的生物学研究成为可能,可以广泛地应用于高置信度靶位点发掘,疾病分子分型和分子通路分析等研究领域上。研究人员现在可以在一张芯片上获取多个样本的全基因组表达谱。超低的芯片价格使您可以以同样的预算获得更多的宝贵数据,更强大的统计学效力和更自信的实验结果。
特点:50碱基的全长探针提供更可靠的特异性和敏感度;
更高密度的芯片降低样本使用量;
冗余度设计(每个点重复30倍)提供更准确的数据;
超低的价格提供更大规模试验可能。

※人类humanWG-6 v3.0全基因组表达谱微珠芯片
※人类humanRef-8 v3.0全基因组表达谱微珠芯片
※人类humanHT-12全基因组表达谱微珠芯片
※小鼠MouseWG-6 v2.0全基因组表达谱微珠芯片
※小鼠MouseRef-8 v2.0全基因组表达谱微珠芯片
※大鼠RatRef-12全基因组表达谱微珠芯片
Illumina定制芯片

Illumina MicroRNA表达谱芯片系列
※MicroRNA表达谱芯片
人类的miRNA芯片上包含了1146个人miRNA,小鼠的miRNA芯片上包含了656个小鼠miRNA。miRNA序列信息来自于最新的Sanger Institute miRBase 数据库12.0和文献报道等到公认的miRNA。每张芯片可同时检测12个或96个样本。

Illumina Genome Analyzer II高通量基因组分析系统

自从诺贝尔奖得主Sanger 1977年发明双脱氧DNA测序方法后,该测序法已独占商业性的DNA测序技术20年,虽然其不断改善的自动化操作已经大大加速了测序的速度,使科学家们能提前几年完成人类基因组草图测序,并测出了另外几百种生物的基因组,但当前普遍使用的测序仪,一次只能读取1,000个左右的碱基,且DNA样品需要长时间的制备和分析,因而科学家们一直在寻求革命性的技术革新:高速测序技术。

Solexa技术最早由两位剑桥大学的化学家创立,利用专利核心技术“DNA簇” 和“可逆性末端终结”,达成自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。 Illumina公司于2007年收购 Solexa,并推出成熟商业产品 Genome Analyzer (基因组分析系统).? Genome Analyzer 为新一代革新性技术分子生物学综合技术平台,具有高准确性,高通量,高灵敏度,和低运行成本等突出优势。可以同时完成传统基因组学研究(测序和注释)以及功能基因组学 (基因表达及调控,基因功能,蛋白/核酸相互作用)研究。

Solexa平台在高通量,高精度,大规模平行测序的基础上,可以完成以下应用:

  1. DNA水平
    1. 基因组测序及注释
    2. 定向基因区域重复测序 – 判定和发现新的基因多态性 (如SNP)
    3. 大规模筛查基因突变如插入缺失,转位等和基因多态性
    4. 基因组甲基化分析
  2. RNA水平
    1. 全基因组广谱基因表达研究
    2. 小RNA扫描,定量,和鉴定
    3. 转录组研究(RNA-Seq)
  3. 蛋白水平
    1. 核酸和蛋白相互作用及定位研究 (如ChIP-Seq研究)

 

传统分子生物学实验服务系列

荧光定量PCR
服务范围:用SYBR方法对RNA进行 real time PCR 的定量测定,用Taqman探针法对DNA进行SNP分型鉴定。
实时荧光定量PCR技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,目前已得到广泛应用。
联合基因08年最新引进的ABI Prism? 7900型荧光定量PCR可满足从中通量到高通量的基因表达定量和SNP多态性实验的需求,并为基因表达提供了绝对定量和相对定量两种定量方法。

DNA测序
服务范围:一般测序、Walking引物测通、大规模测序
作为国内最早(1997)建立测序平台的公司之一,我们具有多年大规模测序的实践经验,拥有经验丰富的技术人员和服务人员,采取ISO9000管理办法,保证到样后48小时出结果,周六照常出结果。
拥有国内最先进测序仪ABI3730测序仪,满足生产规模的测序需求,保证可信测序长度700bp,保证准确率99.5%,极大的节省了您测通的成本;
07年最新引进的ABI3130测序仪,满足中、高通量的测序需求;
提供序列拼接和序列信息分析等完善的生物信息学服务,大规模测序时您可以获得时间和成本上的绝对优势。

抑制性消减杂交(SSH)技术服务
服务范围:SSH文库构建、逆向斑点杂交、DNA序列测序、生物信息学分析
成熟的服务平台,四年完成了上百份样本,几十个个物种包括藻类,苔藓类等等低等生物的筛选,我们的技术和超值的附加服务是您时间和质量的保证。

cDNA文库构建(SMART方法)
服务范围:质粒文库
基于Clontech的SMART方法,独特的技术可以使您获得最多的全长基因,对于某些难于获取的样本所需要的样本量仅为0.5μg mRNA或25μg总RNA。
保证建成的文库插入片段的平均长度≥1kb,库容量达到 1×106 pfu;
完整的实验室构架可以让您同时获得测序,基因芯片等一系列更加优惠的服务,使您更有效的利用您的时间,提高效率。十年多来,联合基因先后进行过线虫、真菌、白色念珠菌、盐藻、华支睾吸虫、油菜、水稻、棉花、大鼠、小鼠、人等数十个物种的cDNA文库构建和unigene测序,先后测定过数百万个序列,拥有丰富的均质化文库构建经验。

Unigene建库测序
服务范围:cDNA文库构建、unigene测序
联合基因自1997年成立以来,一直从事基因的开发研究。
十年多来,先后进行过线虫、真菌、白色念珠菌、盐藻、华支睾吸虫、油菜、水稻、棉花、大鼠、小鼠、人等数十个物种的cDNA文库构建和unigene测序,先后测定过数百万个序列,拥有丰富的均质化文库构建经验。
特殊的RNA抽提技术,辅之以严格的mRNA质量控制,可以最大程度地保证mRNA的完整性,因而也就保证了所测得的unigene中全长cDNA的比例居于国内领先,达到国际先进水平。
均质化文库的构建,可以促使中低丰度的mRNA可以被检测出来;在一定条件下,联合基因独到的基因差减技术,可以将高丰度的mRNA加以去除,使得中低丰度mRNA更容易被测定。
先进的测序设备和熟练的操作技术,可以保证序列的可靠性达99.9%以上;同时联合基因还拥有先进的生物信息分析处理软件和优秀的生物信息分析工程师,使您的后续分析工作再无后顾之忧。
联合基因具备完整的分子生物学实验技术平台,为客户进一步开展基因研究提供了便利。
多年的客户服务经验,也有助于我们可以更好地与客户进行沟通,确保客户的需求及时得到沟通和实现。

Unizol总RNA抽提试剂
Unizol总RNA抽提试剂是博星公司专为基因表达谱实验研制的总RNA提取试剂。由于在配制过程中加入了含有高效的RNA酶灭活剂,Unizol能够在匀浆过程中迅速灭活RNA酶,保持RNA的完整性,特别是低丰度基因的信息可以得到完整的保存。经过长时间和多方面的验证,Unizol的适用对象很广,可以从动物、植物组织或细胞,以及全血、白细胞中提取高质量的总RNA。用Unizol提取的RNA只有微量DNA和蛋白质的污染,可直接用于基因表达谱芯片以及Northern Blot、RT-PCR等分子生物学实验。


生物信息学服务系列

SNP相关数据生物信息学服务
提供SNP相关数据的统计分析及生物信息学分析服务,可帮助客户进行前期样本设计,分型位点选择和后期分型数据分析等工作:

  1. TagSNP位点选择
  2. genomic control位点选择
  3. 单位点关联分析
  4. 单倍型分析
  5. 基因-基因及基因-环境互作分析
  6. 全基因组关联分析
  7. 家系连锁分析
  8. 分型与表达数据相关分析
  9. 阳性位点潜在功能生物信息学分析等

基因表达相关数据生物信息学服务
针对基因表达(含基因表达谱芯片、RT-PCR等检测技术)检测数据,提供基因表达和蛋白调控网络、疾病分类的预测标志物筛选,药物靶向基因筛选等热点问题的生物信息学分析服务。

  1. 纯数据分析——TwoClassDiff 两分类的差异基因筛选
  2. 纯数据分析——MultiClassDiff 多分类的差异基因筛选
  3. 纯数据分析——Stc 序列试验基因表达趋势分析
  4. 功能分析——Stc-GO 序列试验共表达基因的功能显著性分析
  5. 功能分析——GO-Analysis 基因功能综合分析
  6. 功能分析——Path-Finder 信号转导通路的显著性分析
  7. 诊断标志物分析——Marker 疾病的分子标志物筛选
  8. 诊断标志物分析——Marker-MDS 分子标志物分类样本的三维空间展示
  9. 诊断标志物分析——DPPMA Diagnosis And Prognosis Prediction Model Analysis
  10. 网络分析——Path-Net Pathway的功能关联网络构建
  11. 网络分析——GeneFunNet 基因的功能关联网络构建
  12. 网络分析——Netloc-Cluster 网络位置聚类分析
  13. 网络分析——Dynamic-GeneNet 动态样本的基因调控网络构建

 

上海博星基因芯片有限责任公司

总部地址:上海市国泰路11号复旦大学科技园706室
平台地址:上海市邯郸路100号54号楼甲楼3楼
免费咨询电话:800-720-0130
联系电话:021-52162135,021-61400215
E-mail:8007200@163.com

地址:上海市国泰路119楼 邮编:200433 电话:61406788 转各分机 传真:61406789
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